исходя из общей логики, скорее всего, нет, поскольку если пароль ставится без перепаковки архива, то сами данные, получается, как были не защищены, так и остались

в случае с винраром:
Tools - Convert archives - выставляете в настройках сжатия пароль в правом верхнем углу отметите архивы рар

в результате винрар перепакует все архивы, проставив для них пароль